Название в честь Трех Святителей неслучайно. Когда-то, в здании Екатеринодарского Николаевского коммерческого училища находился домовый храм в честь святителя Василия Великого. А Николаевским здание было названо в честь посещения города Николаем II. Во время оккупации немцами, здание было сожжено и домовая церковь была разрушена. В память о домовой церкви училища в честь Василия Великого и был открыт храм во имя Трех Святителей — Василия Великого, Григория Богослова и Иоанна Златоуста.